Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tgfb1P04202 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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