Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamc1P02468 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamc1P02468 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms