Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms