Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01740 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01740 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01740 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01740 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01740 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01740 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01740 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01740 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01740 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01740 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01740 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01740 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01740 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01740 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01740 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01740 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01740 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01740 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01740 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01740 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01740 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01740 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01740 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01740 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01740 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01740 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01740 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01740 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01740 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01740 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01740 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01740 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01740 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01740 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01740 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01740 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01740 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01740 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms