Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01679 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01679 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01679 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01679 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01679 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01679 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01679 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01679 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms