Protein–RNA interactions for Protein: P01670

Ig kappa chain V-III region PC 6684, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01670 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01670 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01670 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01670 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01670 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01670 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01670 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01670 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01670 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01670 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01670 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01670 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01670 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01670 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01670 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01670 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01670 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01670 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01670 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01670 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01670 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01670 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01670 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01670 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01670 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01670 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms