Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01664 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01664 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01664 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01664 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01664 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01664 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01664 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01664 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01664 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01664 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01664 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01664 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01664 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01664 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01664 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01664 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01664 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01664 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01664 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms