Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01636 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01636 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01636 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01636 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01636 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01636 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01636 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01636 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01636 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01636 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01636 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01636 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01636 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01636 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01636 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01636 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01636 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01636 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01636 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01636 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01636 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01636 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01636 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01636 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01636 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01636 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01636 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01636 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01636 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01636 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01636 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01636 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01636 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01636 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01636 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01636 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01636 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01636 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01636 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01636 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01636 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01636 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01636 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms