Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casp8O89110 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casp8O89110 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casp8O89110 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp8O89110 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms