Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp1O89090 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms