Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tom1O88746 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Tom1O88746 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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Tom1O88746 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tom1O88746 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Tom1O88746 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tom1O88746 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tom1O88746 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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Tom1O88746 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Tom1O88746 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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Tom1O88746 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Tom1O88746 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Tom1O88746 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Tom1O88746 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Tom1O88746 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tom1O88746 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Tom1O88746 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tom1O88746 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Tom1O88746 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Tom1O88746 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tom1O88746 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tom1O88746 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tom1O88746 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tom1O88746 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tom1O88746 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tom1O88746 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tom1O88746 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tom1O88746 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tom1O88746 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tom1O88746 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tom1O88746 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tom1O88746 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tom1O88746 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tom1O88746 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tom1O88746 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tom1O88746 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms