Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BlmO88700 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BlmO88700 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BlmO88700 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BlmO88700 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BlmO88700 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BlmO88700 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BlmO88700 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BlmO88700 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
BlmO88700 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BlmO88700 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BlmO88700 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BlmO88700 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BlmO88700 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BlmO88700 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BlmO88700 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BlmO88700 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BlmO88700 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BlmO88700 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BlmO88700 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BlmO88700 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BlmO88700 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BlmO88700 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BlmO88700 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BlmO88700 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BlmO88700 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BlmO88700 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BlmO88700 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BlmO88700 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BlmO88700 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BlmO88700 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BlmO88700 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BlmO88700 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BlmO88700 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BlmO88700 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BlmO88700 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BlmO88700 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BlmO88700 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BlmO88700 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BlmO88700 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BlmO88700 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BlmO88700 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BlmO88700 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BlmO88700 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BlmO88700 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BlmO88700 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BlmO88700 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BlmO88700 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BlmO88700 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BlmO88700 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BlmO88700 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BlmO88700 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BlmO88700 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BlmO88700 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BlmO88700 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BlmO88700 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BlmO88700 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BlmO88700 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BlmO88700 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BlmO88700 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BlmO88700 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BlmO88700 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BlmO88700 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BlmO88700 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BlmO88700 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BlmO88700 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BlmO88700 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
BlmO88700 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
BlmO88700 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BlmO88700 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BlmO88700 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BlmO88700 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BlmO88700 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BlmO88700 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BlmO88700 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BlmO88700 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BlmO88700 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BlmO88700 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BlmO88700 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BlmO88700 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BlmO88700 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BlmO88700 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms