Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Cops6O88545 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Cops6O88545 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Cops6O88545 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Cops6O88545 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Cops6O88545 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Cops6O88545 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cops6O88545 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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Cops6O88545 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Cops6O88545 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Cops6O88545 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Cops6O88545 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cops6O88545 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cops6O88545 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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