Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dll3O88516 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dll3O88516 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dll3O88516 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms