Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capns1O88456 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capns1O88456 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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