Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AvilO88398 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AvilO88398 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AvilO88398 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AvilO88398 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AvilO88398 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AvilO88398 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AvilO88398 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AvilO88398 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AvilO88398 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AvilO88398 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AvilO88398 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AvilO88398 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AvilO88398 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AvilO88398 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AvilO88398 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AvilO88398 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AvilO88398 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AvilO88398 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AvilO88398 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AvilO88398 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AvilO88398 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AvilO88398 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AvilO88398 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AvilO88398 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AvilO88398 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AvilO88398 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AvilO88398 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms