Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnt1O88346 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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Tnnt1O88346 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt1O88346 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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