Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnal1O88327 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnal1O88327 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms