Protein–RNA interactions for Protein: O70477

Pknox1, Homeobox protein PKNOX1, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox1O70477 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pknox1O70477 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pknox1O70477 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms