Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Supt5hO55201 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Supt5hO55201 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms