Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms