Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms