Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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BckdkO55028 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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BckdkO55028 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BckdkO55028 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BckdkO55028 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdkO55028 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BckdkO55028 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BckdkO55028 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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