Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6bO54951 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms