Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbrO54799 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbrO54799 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbrO54799 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbrO54799 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbrO54799 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms