Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DffaO54786 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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DffaO54786 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DffaO54786 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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DffaO54786 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffaO54786 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffaO54786 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffaO54786 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffaO54786 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffaO54786 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DffaO54786 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffaO54786 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DffaO54786 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffaO54786 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffaO54786 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffaO54786 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DffaO54786 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DffaO54786 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DffaO54786 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DffaO54786 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DffaO54786 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DffaO54786 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DffaO54786 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DffaO54786 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DffaO54786 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DffaO54786 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffaO54786 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffaO54786 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffaO54786 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffaO54786 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffaO54786 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffaO54786 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffaO54786 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffaO54786 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DffaO54786 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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