Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cavin1O54724 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cavin1O54724 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms