Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EdaO54693 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EdaO54693 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EdaO54693 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EdaO54693 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EdaO54693 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EdaO54693 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EdaO54693 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EdaO54693 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EdaO54693 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EdaO54693 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EdaO54693 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EdaO54693 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EdaO54693 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EdaO54693 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EdaO54693 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EdaO54693 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EdaO54693 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EdaO54693 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EdaO54693 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EdaO54693 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms