Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pik3cdO35904 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms