Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npc1O35604 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npc1O35604 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms