Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-ObO35424 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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