Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcc1O35379 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms