Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2O35245 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms