Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bhlhe40O35185 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms