Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smad6O35182 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms