Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms