Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ArxO35085 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ArxO35085 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ArxO35085 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ArxO35085 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ArxO35085 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ArxO35085 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ArxO35085 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms