Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgisO35074 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgisO35074 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgisO35074 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgisO35074 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgisO35074 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgisO35074 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgisO35074 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgisO35074 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgisO35074 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgisO35074 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgisO35074 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgisO35074 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgisO35074 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgisO35074 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtgisO35074 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtgisO35074 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtgisO35074 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtgisO35074 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtgisO35074 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgisO35074 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgisO35074 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgisO35074 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgisO35074 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgisO35074 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms