Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cldn4O35054 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cldn4O35054 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cldn4O35054 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cldn4O35054 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cldn4O35054 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cldn4O35054 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cldn4O35054 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cldn4O35054 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cldn4O35054 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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