Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sypl1O09117 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sypl1O09117 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms