Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20939L7N243 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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