Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IfnabL7MTU6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnabL7MTU6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms