Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm2888K7N746 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2888K7N746 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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