Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Bank1-205ENSMUST00000198206 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Gm21887J3QQ04 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms