Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm5849J3QPE5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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