Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim22J3QP37 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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