Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa8J3QNX5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa8J3QNX5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa8J3QNX5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa8J3QNX5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa8J3QNX5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa8J3QNX5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa8J3QNX5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa8J3QNX5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa8J3QNX5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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