Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4b4J3QNS5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms