Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim18J3QNP2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms