Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc180J3QNE4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms